ポケモンを不正に作成するアプリがあるんですね。

こういうアプリで作成したデータは、メーカーの想定外のデータである可能性が高いです。

そんなデータを使った場合、アプリ自体が正常に起動できなかったり、
合成や進化の段階で異常終了する可能性もあります。

自分の不正によって壊れたデータは、保証対象外です。
メーカーに修理依頼をしても、「不正改造のデータ」として拒否されるでしょう。

正規の方法・ルールの中で楽しむのがゲームです。

参考：『ポケットモンスター』シリーズをお楽しみ頂いている皆さまへお知らせ
http://www.nintendo.co.jp/support/information/2013/0628.html